Pathologie Moléculaire


Objectifs de l'utilisation des techniques moléculaires


Les techniques moléculaires sont utilisées à différentes fins en pathologie.

Il est utilisé pour diagnostiquer des tumeurs ou des maladies infectieuses et pour déterminer des sous-types de tumeurs avec des tests appropriés après l'évaluation morphologique d'un pathologiste compétent. La morphologie complémentaire et les examens moléculaires sont devenus partie intégrante l'un de l'autre dans le diagnostic, le suivi et le traitement des patients oncologiques. En effet, les noms de certaines tumeurs (tumeurs cérébrales et divers sarcomes) ont été modifiés par comparaison des techniques moléculaires et des morphologies, et de nouveaux groupes de diagnostic ont été créés.
Avec la présence ou l'absence de mutation dans les tissus cancéreux, l'utilisation de thérapies ciblées est possible. La présence ou l'absence de ces mutations est déterminée par des tests appliqués en pathologie moléculaire. Par example; Les tests EGFR, ALK, ROS1 dans le cancer du poumon, les tests KRAS, NRAS, BRAF dans le cancer du côlon/cancer intestinal, le test Her2 dans le cancer du sein et le cancer de l'estomac, le test BRAF dans le cancer de la thyroïde et le cancer de la peau font partie des tests de routine en oncologie.
Bien que l'évolution de la maladie soit très dépendante de raisons personnelles, il est nécessaire de connaître l'évolution possible de la maladie pour une prise en charge thérapeutique adaptée au patient. Pour cette raison, certaines techniques moléculaires utilisées guident les spécialistes en oncologie. Par example; Les tests MSI (Microsatellite Instability), qui montrent la possibilité d'un cancer héréditaire dans le cancer de l'utérus, sont désormais appliqués en routine dans l'examen anatomopathologique.

Techniques utilisées en pathologie moléculaire

Similaire aux études immunohistochimiques utilisées quotidiennement dans la pratique de la pathologie, elle permet la détection de structures protéiques résultant de mutations. Il est utilisé dans la détection de certaines mutations (comme BRAF dans les cancers de la thyroïde et de la peau, IDH1 dans les tumeurs cérébrales) car il est rapide et pratique.
Il s'agit de tests utilisant des compteurs spéciaux (complémentaires) d'ADN et d'ARN qui se lient à l'ADN ou aux ARN dans les cellules. Détection de virus (EBER dans divers lymphomes, HPV dans le cancer du col de l'utérus), détection de foyer tumoral (albumine dans le foie), détection de modifications chromosomiques (perte 1p19q dans les tumeurs cérébrales, fusion BCR-ABL dans certains lymphomes) et détection d'expressions génétiques accrues (HER2, EGFR dans le cancer du sein et de l'estomac) sont utilisés.
FlSH (hybridation in-situ fluorescente) :
Il s'agit d'études d'hybridation in situ utilisant des kits fluorescents spéciaux et des microscopes fluorescents spéciaux.
CISH (Chromogen in-situ hybridization) : Ce sont les examens qui permettent d'effectuer l'hybridation in-situ également avec la microscopie optique.
La réaction en chaîne par polymérase (Polymerase Chain Reaction) est le processus de réplication de l'ADN ou de l'ARN obtenu à partir de tissus en laboratoire. S'il y a une mutation dans un certain nombre de temps de réplication, suffisamment de nouvel ADN ou ARN est formé et la présence d'une mutation (par exemple, tests KRAS, NRAS, BRAF dans le cancer du côlon/cancer intestinal) est détectée.
Les mutations observées dans les tumeurs sont très diverses. Si certaines mutations sont le principal facteur de prolifération de la tumeur, certaines restent seulement endommagées et n'affectent pas le comportement de la tumeur (biologie tumorale). Ces mutations « pilotes » qui affectent le comportement tumoral et les mutations « passagers » qui n'affectent pas le comportement diffèrent en termes de diagnostic, de traitement et de survie. Pour cette raison, des analyses spécifiques à des mutations sélectionnées (analyses de mutations ponctuelles) pouvant déterminer directement le comportement tumoral sont utilisées en pathologie moléculaire.
C'est l'analyse faite en lisant les bases d'une séquence d'ADN une à une. Ainsi, on comprend avec quel changement la mutation s'est produite et le diagnostic et le choix du traitement sont faits en conséquence.
Toutes les mutations dans une tumeur peuvent être détectées avec un séquençage de nouvelle génération basé sur la lecture simultanée de plusieurs loci d'ADN. Il est utilisé pour détecter des mutations qui ne sont pas fréquemment observées dans la tumeur concernée, mais qui ont des médicaments pour le traitement, en particulier au stade avancé et chez les patients qui ont terminé leur premier traitement. Le système, qui est situé dans un nombre limité de centres en Turquie, est utilisé dans le laboratoire de génétique commémorative accrédité ISO 15189.
Les dommages qui provoquent des changements dans l'ADN sont appelés mutations. Des mutations se produisent dans presque toutes les divisions cellulaires et presque toutes sont réparées. Ces mutations s'accumulent parce que les cellules cancéreuses se développent trop rapidement et que les mécanismes de réparation ne peuvent pas apporter les corrections adéquates. La charge de mesure des mutations obtenue par le rapport de cette accumulation mutée à la quantité totale d'ADN a récemment commencé à être utilisée dans la sélection des traitements. Plus il y a de mutations dans une tumeur (comme le cancer de la peau/les mélanomes), plus les antigènes étrangers seront produits et ces tumeurs répondront mieux aux traitements immunomodulateurs (tests PD1-PDL1 utilisés dans de nombreux types de cancer, notamment le cancer du poumon).